PscanServではXDWの加工までは行えないため、Docuworks出力では、分割や結合はできません。
JOBを2つ連結させて頂く運用により回避可能か、御検討頂けますでしょうか。

1. A_JOB にて結合・分割の処理を行い、PDFやTIFFへ出力を行う。
2. B_JOBにてA_JOBの出力先を監視し、A_JOBから出力された結合後・分割後のデータをDocuworks出力する。